MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015942	TGAT	2	8	118208	118215	25 %	50 %	25 %	0 %	344198345
2502	NC_015942	CCA	2	6	118358	118363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198345
2503	NC_015942	ATG	2	6	118445	118450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198345
2504	NC_015942	AGC	2	6	118483	118488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198345
2505	NC_015942	AAT	2	6	118516	118521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198345
2506	NC_015942	AAC	2	6	118528	118533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198345
2507	NC_015942	TAT	2	6	118540	118545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198345
2508	NC_015942	TGG	2	6	118569	118574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198345
2509	NC_015942	CAA	2	6	118714	118719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198345
2510	NC_015942	TTAT	2	8	118787	118794	25 %	75 %	0 %	0 %	344198345
2511	NC_015942	TGT	2	6	118841	118846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198345
2512	NC_015942	TAA	2	6	118881	118886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198345
2513	NC_015942	TAT	2	6	118918	118923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198345
2514	NC_015942	CTG	2	6	119029	119034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198345
2515	NC_015942	AATCAG	2	12	119044	119055	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	344198345
2516	NC_015942	GC	3	6	119111	119116	0 %	0 %	50 %	50 %	344198345
2517	NC_015942	ACA	2	6	119123	119128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198345
2518	NC_015942	CT	4	8	119131	119138	0 %	50 %	0 %	50 %	344198345
2519	NC_015942	TTTCA	2	10	119249	119258	20 %	60 %	0 %	20 %	344198345
2520	NC_015942	CAA	2	6	119271	119276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198345
2521	NC_015942	GCC	2	6	119281	119286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198345
2522	NC_015942	CAA	2	6	119348	119353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198345
2523	NC_015942	CCGG	2	8	119446	119453	0 %	0 %	50 %	50 %	344198345
2524	NC_015942	TAC	2	6	119584	119589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198345
2525	NC_015942	GAC	2	6	119596	119601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198345
2526	NC_015942	ATC	2	6	119611	119616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198345
2527	NC_015942	GGT	2	6	119625	119630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198345
2528	NC_015942	ACC	2	6	119633	119638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198345
2529	NC_015942	TCA	2	6	119662	119667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198345
2530	NC_015942	GCG	2	6	119675	119680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198345
2531	NC_015942	ATCTGT	2	12	119714	119725	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	344198345
2532	NC_015942	TAC	2	6	119766	119771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198345
2533	NC_015942	CTA	2	6	119841	119846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198345
2534	NC_015942	TGG	2	6	119887	119892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198345
2535	NC_015942	AAC	2	6	119923	119928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198345
2536	NC_015942	TTTG	2	8	120009	120016	0 %	75 %	25 %	0 %	344198345
2537	NC_015942	GCAT	2	8	120020	120027	25 %	25 %	25 %	25 %	344198345
2538	NC_015942	ACA	2	6	120074	120079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198345
2539	NC_015942	TGG	3	9	120096	120104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198345
2540	NC_015942	GTA	2	6	120300	120305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_015942	TGTT	2	8	120309	120316	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_015942	TGG	2	6	120329	120334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_015942	T	6	6	120392	120397	0 %	100 %	0 %	0 %	344198346
2544	NC_015942	AAC	2	6	120454	120459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198346
2545	NC_015942	CCA	2	6	120525	120530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198346
2546	NC_015942	GTGAA	2	10	120537	120546	40 %	20 %	40 %	0 %	344198346
2547	NC_015942	CT	4	8	120704	120711	0 %	50 %	0 %	50 %	344198346
2548	NC_015942	GGC	2	6	120740	120745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198346
2549	NC_015942	CG	3	6	120757	120762	0 %	0 %	50 %	50 %	344198346
2550	NC_015942	GCG	2	6	120780	120785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198346
2551	NC_015942	AAT	2	6	120863	120868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198346
2552	NC_015942	CA	3	6	120876	120881	50 %	0 %	0 %	50 %	344198346
2553	NC_015942	TGG	2	6	120883	120888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198346
2554	NC_015942	GAT	2	6	120919	120924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198346
2555	NC_015942	CCG	2	6	120960	120965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198346
2556	NC_015942	CGG	2	6	120985	120990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198346
2557	NC_015942	ACA	2	6	121146	121151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198346
2558	NC_015942	GTTC	2	8	121164	121171	0 %	50 %	25 %	25 %	344198346
2559	NC_015942	CCCAG	2	10	121177	121186	20 %	0 %	20 %	60 %	344198346
2560	NC_015942	CGG	2	6	121243	121248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198346
2561	NC_015942	CG	3	6	121263	121268	0 %	0 %	50 %	50 %	344198346
2562	NC_015942	CAG	2	6	121352	121357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198346
2563	NC_015942	TA	3	6	121526	121531	50 %	50 %	0 %	0 %	344198346
2564	NC_015942	CAA	2	6	121652	121657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198346
2565	NC_015942	CAC	2	6	121660	121665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198346
2566	NC_015942	ACA	2	6	121680	121685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198346
2567	NC_015942	CGT	2	6	121704	121709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198346
2568	NC_015942	CAGT	2	8	121714	121721	25 %	25 %	25 %	25 %	344198346
2569	NC_015942	AAC	2	6	121742	121747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198346
2570	NC_015942	TGC	2	6	121813	121818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198346
2571	NC_015942	TAA	2	6	121843	121848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198346
2572	NC_015942	AT	3	6	121979	121984	50 %	50 %	0 %	0 %	344198346
2573	NC_015942	ATA	2	6	122019	122024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198346
2574	NC_015942	CGG	2	6	122047	122052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198346
2575	NC_015942	GAT	2	6	122131	122136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198346
2576	NC_015942	ACT	3	9	122163	122171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198346
2577	NC_015942	ATC	2	6	122175	122180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198346
2578	NC_015942	CCAAA	2	10	122221	122230	60 %	0 %	0 %	40 %	344198346
2579	NC_015942	GGT	2	6	122248	122253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198346
2580	NC_015942	CCT	2	6	122286	122291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198346
2581	NC_015942	ACG	2	6	122366	122371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198346
2582	NC_015942	TAC	2	6	122435	122440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198346
2583	NC_015942	AAC	2	6	122504	122509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198346
2584	NC_015942	AGC	2	6	122535	122540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198346
2585	NC_015942	ATAC	2	8	122596	122603	50 %	25 %	0 %	25 %	344198346
2586	NC_015942	GGT	2	6	122699	122704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198346
2587	NC_015942	ATT	2	6	122866	122871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_015942	ACCC	2	8	122880	122887	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2589	NC_015942	TGA	2	6	122929	122934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_015942	GTT	2	6	122968	122973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_015942	ATT	2	6	122976	122981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_015942	ACA	2	6	123014	123019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_015942	TGA	2	6	123070	123075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_015942	GCG	2	6	123085	123090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2595	NC_015942	AAT	2	6	123115	123120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_015942	TA	3	6	123139	123144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_015942	TCA	2	6	123145	123150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_015942	AAG	2	6	123193	123198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198347
2599	NC_015942	TGG	2	6	123228	123233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198347
2600	NC_015942	AT	3	6	123438	123443	50 %	50 %	0 %	0 %	344198347
2601	NC_015942	AG	3	6	123466	123471	50 %	0 %	50 %	0 %	344198347
2602	NC_015942	GCG	2	6	123495	123500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198347
2603	NC_015942	CTT	2	6	123553	123558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198347
2604	NC_015942	TTTC	2	8	123644	123651	0 %	75 %	0 %	25 %	344198347
2605	NC_015942	TGG	2	6	123671	123676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198347
2606	NC_015942	TAG	2	6	123743	123748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198347
2607	NC_015942	ACT	2	6	123787	123792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2608	NC_015942	AGT	2	6	123803	123808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_015942	CGG	2	6	123809	123814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_015942	TA	3	6	123829	123834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_015942	AGT	2	6	123839	123844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_015942	TCG	2	6	123919	123924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_015942	GCCG	2	8	123946	123953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2614	NC_015942	TAT	2	6	123986	123991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_015942	TGGC	2	8	123996	124003	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2616	NC_015942	AGCA	2	8	124021	124028	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2617	NC_015942	ACC	2	6	124031	124036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2618	NC_015942	ATT	2	6	124080	124085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198348
2619	NC_015942	CGC	2	6	124144	124149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198348
2620	NC_015942	GAT	2	6	124150	124155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198348
2621	NC_015942	TGC	2	6	124170	124175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198348
2622	NC_015942	TCT	2	6	124179	124184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198348
2623	NC_015942	TCA	2	6	124215	124220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198348
2624	NC_015942	GTA	2	6	124268	124273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_015942	GTC	2	6	124292	124297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2747	NC_015942	CAT	2	6	129778	129783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198352
2748	NC_015942	G	6	6	129942	129947	0 %	0 %	100 %	0 %	344198352
2749	NC_015942	GAT	2	6	129961	129966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198352
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2752	NC_015942	GC	4	8	130161	130168	0 %	0 %	50 %	50 %	344198352
2753	NC_015942	CGG	2	6	130194	130199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
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2760	NC_015942	CAG	2	6	130414	130419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198352
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2851	NC_015942	GC	3	6	133952	133957	0 %	0 %	50 %	50 %	344198353
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2977	NC_015942	CAT	2	6	139728	139733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2980	NC_015942	TGAA	2	8	139842	139849	50 %	25 %	25 %	0 %	344198358
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2988	NC_015942	TGA	2	6	140328	140333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198358
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2990	NC_015942	GACGC	2	10	140517	140526	20 %	0 %	40 %	40 %	344198358
2991	NC_015942	CGA	2	6	140544	140549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198358
2992	NC_015942	CCG	2	6	140573	140578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198358
2993	NC_015942	GA	3	6	140957	140962	50 %	0 %	50 %	0 %	344198359
2994	NC_015942	ATCG	2	8	140983	140990	25 %	25 %	25 %	25 %	344198359
2995	NC_015942	GGT	2	6	141009	141014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198359
2996	NC_015942	TGG	2	6	141083	141088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198359
2997	NC_015942	CAT	2	6	141121	141126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198359
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2999	NC_015942	GGCA	2	8	141140	141147	25 %	0 %	50 %	25 %	344198359
3000	NC_015942	CTT	2	6	141155	141160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198359

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